La molecola è la più piccola quantità di una sostanza in grado di conservarne la composizione chimica e di determinarne le proprietà e il comportamento chimico e chimico-fisico.
Le molecole sono il risultato tra la reazione di 2 atomi o tra altre molecole. Le molecole si formano dai legami chimici, cioè dalla condivisione di elettroni tra due o più elementi chimici, aventi lo scopo di generare una situazione energetica più stabile per tutti i singoli componenti della molecola. Una molecola, nel suo complesso è elettricamente neutra.
Una molecola può essere composta da più atomi di un solo elemento chimico o da atomi di elementi diversi. Famiglie di molecole costituite dagli stessi atomi disposti nello spazio in maniera diversa sono dette isomeri; la disposizione influisce sulle proprietà fisiche della sostanza.